Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd1Q9CQK7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd1Q9CQK7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms