Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufb9Q9CQJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms