Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms