Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms