Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudcd2Q9CQ48 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms