Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms