Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms