Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11bQ99PV8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms