Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms