Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim12aQ99PQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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