Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms