Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gtf2a1Q99PM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms