Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rrbp1Q99PL5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms