Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcgf6Q99NA9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pcgf6Q99NA9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcgf6Q99NA9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms