Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac9Q99N13 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms