Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd1Q99MV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd1Q99MV1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms