Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms