Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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PtprtQ99M80 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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PtprtQ99M80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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PtprtQ99M80 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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PtprtQ99M80 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
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PtprtQ99M80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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PtprtQ99M80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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PtprtQ99M80 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PtprtQ99M80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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PtprtQ99M80 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprtQ99M80 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
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