Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gins4Q99LZ3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms