Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms