Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnpo2Q99LG2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms