Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp16Q99LG0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp16Q99LG0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms