Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms