Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ciao1Q99KN2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms