Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms