Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms