Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed9Q99KF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms