Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlgn1Q99K10 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlgn1Q99K10 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms