Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3mQ99JX4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3mQ99JX4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms