Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd6Q99JI4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms