Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms