Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Def8Q99J78 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms