Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf144aQ925F3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms