Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Letmd1Q924L1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Letmd1Q924L1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms