Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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