Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp3Q923K4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp3Q923K4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp3Q923K4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms