Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms