Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp4Q921I6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms