Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc1bQ920F6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms