Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Afg3l1Q920A7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Afg3l1Q920A7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms