Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc5a4bQ91ZP4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms