Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd3Q91WC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd3Q91WC0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms