Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn8Q91VA3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms