Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms