Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RestQ8VIG1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RestQ8VIG1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RestQ8VIG1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RestQ8VIG1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RestQ8VIG1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms