Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Odf4Q8VI88 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms