Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng5Q8VHW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacng5Q8VHW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms