Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng8Q8VHW2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms