Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdd2Q8VEK2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms