Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms